Kasna jesen je najbolje vrijeme za vapnenje supstrata. Na drveću obično nema lišća, tako da minimiziramo rizik od oštećenja biljaka gnojivom s kalcijem, koje bi moglo izgorjeti.S vapnenjem supstrata počinjemo po vremenu bez vjetra.Ako je pH u vrtu jako nizak, možemo upotrijebiti vapno u obliku oksida.
Djeluje brzo, ali dosta agresivno, stoga je sigurnije koristiti karbonatno vapno koje je, iako ne otkiseljuje tlo tako brzo, sigurnije za korištenje, jer se kalcij dugo oslobađa. Vrijedno je spomenuti da su nagle promjene pH štetne i za biljke i za mikroorganizme.
Puno bolja praksa je raširiti odkiseljavanje supstrata tijekom vremena.Umjesto gnojidbe velikim dozama vapna svakih nekoliko godina, sigurnije je gnojiti s vapno svake dvije godine, ali u manjim dozama.
